菏泽市立医院现拥国内先进的高端大型诊疗设备，设备总值近2亿元。如美国瓦里安 23EX 直线加速器， 64排螺旋CT、1.5T超导磁共振、全数字化乳腺X光机、高档血管造影系统、DR、CR、DSA、X线刀，各类国内外先进的电子镜、超声内镜、关节镜、高清腹(胸)腔、脑室镜、输尿管镜、血液透析设备、3D彩色超声仪、全数字化彩超、心脏彩超、全自动五分类血液分析仪、全自动生化分析仪、高级麻醉工作站和一定规模ICU、EICU、CCU、NICU;拥有国际一流净化手术室和标准无菌层流净化病房。2013年先后投入9523万元招标采购了中国第一台微平板超高端256排螺旋CT、世界最高端3.0T西门子磁共振和经济型PET-CT等高端设备。
菏泽市立医院实施“坚持以病人为中心”全程优质服务，全年无假日应诊。医院紧跟公立医院改革步伐，积极参与其中，扎实开展对口支援基层医疗机构、优质护理服务的示范工程、优化门诊服务流程、实施门诊预约诊疗服务、开展临床路径管理、引进第三方医疗纠纷处理机制等各项工作。创新服务模式取得了良好的成效。
连续多年被省、市卫生主管部门评为先进集体、精神文明先进单位。医院现为淮海经济区十佳医院、卫生部国际紧急救援中心定点医院、国家级爱婴医院。
