济宁市第一人民医院学科建设成果丰硕，中西医结合被评为国家级重点专业，内科为国家卫计委脑卒中筛查与防治基地和国家卫计委脑卒中筛查与防治科研型基地，无痛内镜中心为卫生部舒适化医疗研究基地、中国医师协会麻醉学医师分会无痛内镜培训基地，心胸、呼吸科、普外科、麻醉科、消化科、科、经自然腔道内镜外科等被评定为国家卫计委内镜与微创专业技术培训基地，临床药学部为国家卫计委临床药师培训基地，心电图室为中华医学会心血管病学分会中国心电学基地。神经外科、儿科、急诊科、心内科、神经内科、科眼科、呼吸科等为山东省医药卫生重点专业;急诊科、临床护理、血液内科、神经外科、呼吸科、麻醉科、皮肤科、普外科等为山东省省级临床重点专科;为省级临床重点专科创建单位。
济宁市第一人民医院立足“健康济宁、走进基层、服务大众、百姓”的服务理念， 2009年11月，率先开展“健康济宁”大型系列行动。投资480万元，购置了山东省首台配备了DR、彩超、心电监护仪等设备的“心连心健康直送车”。走进济宁及周边地区的山区、湖区、革命老区、偏远农村及社区，等十二县市区520余站地，惠及60万多群众，培训基层医生10000人次。 “名医下乡，群众得福!”已成为了鲁西南地区广大群众的口碑。中央电视台联播节目先后4次对我院“健康济宁”活动进行了报道。2013年国家卫生计生委主办的2013中国脑卒中大会期间， “健康直送车”受邀进京为首都人民健康服务。
济宁市第一人民医院的科学跨越发展引起各级领导、社会各界的广泛赞誉，中央电视台、健康报、大众日报、山东电视台等媒体多次报道医院的典型事迹。医院多次被评为“全国卫生系统先进集体”，先后荣获 “全国百姓放心示范医院”、 “全国综合医院中医药工作示范单位”、“全国医院感染现患率调查先进单位”、“全省先进基层党组织”、“富民兴鲁劳动奖状”等荣誉，荣获2010、2011、2012年度 “全国医院改革创新奖”三连冠，实现 2010、2011、2012 “济宁市双评活动‘与人民群众生产、生活密切相关的行业单位’” 第1名。2012年4月17日，在成都全国医疗卫生系统“三好一满意”活动第三次工作会议上，做为山东省唯一代表作典型经验介绍。2012年4月23日时任中共中央政治局常委、中央纪委书记贺国强出席并作重要讲话的中纪委济南加强基层党风廉政建设座谈会上，做为全省卫生系统唯一代表受邀作典型汇报。
