济宁医学院附属医院从患者角度出发，不断创新服务模式。推出整体化优质护理服务，目前对所有病区实施了优质护理服务，有效缓解了“一人看病，全家受累”的局面;医院积极开展以术后镇痛为主的无痛诊疗工作，对患者进行疼痛评估、镇静评估、病情评估，大大减轻患者术后痛苦，实现快速康复，保障了医疗质量与安全;全力做好疾病管理工作，进行病人家访，让患者拥有“家庭医生”;推出科室运营助理、门诊医生助理、医护一体化等服务举措，减少了病人门诊等待时间并延长有效就诊时间;优化门诊配置和布局，设立多学科门诊、专科专病门诊、疑难病会诊中心等，有效提高了诊疗质量，大大解决了目前医院中普遍存在的“三长一短”(挂号、交费、取药时间长，就医时间短)问题，患者综合满意度在99%以上，真正做到了“服务好、质量好、医德好、患者满意”。
济宁医学院附属医院关注社会事业。自2005年以来面向全国开展“爱心医疗救助工程”，每年免费救治100例特困家庭的先心病患儿，截至目前已成功为全国24个省市自治区的900余名先心病患儿免费实施了爱心手术，成功率100%。2013年医院与青海慈善总会、青海红十字医院达成救助协议，爱心救助走进青海，全年免费救助青海先心病患儿40余例，赢得了良好的社会声誉，增强了民族情谊。医院打造的“大爱无疆”服务品牌，受到社会的广泛赞誉。
