首先，肥胖男性体脂量增加，可使雄激素较多地转化为雌激素，雌激素偏高，比普通男性高1倍以上，而且后者又抑制垂体促性腺激素分泌，进而使睾丸酮分泌减少，由此可能妨碍精子的生成和精子质量。
其次，肥胖男子脂肪较多，因而他们的体温比正常人更高。人的正常体温是37℃左右，而精子生成的最佳温度要比正常温度低2℃。肥胖男子脂肪较多，因而他们的体温比正常人更高，会直接影响到睾丸的生精能力，造成精子生成减少。即使精子生成数量不受影响，但生成后的精子质量也会受到影响。
再次，肥胖会引发糖尿病或隐性糖尿病，血液中糖水平较高，可损害精子中的DNA，并因此影响男性的生育力。据沈昌理介绍，贝尔法斯特王后大学的科恩·马里迪斯团队在对40名体重没有超重的糖尿病男性患者进行治疗时发现，由于患糖尿病，患者血液中糖水平较高，由此损害了他们精子中的DNA。
研究者发现，糖尿病患者精子损害的几率是未患糖尿病正常男性的两倍。精子DNA的变化会导致怀孕率较低，有较高的流产风险，并可能导致一些严重的出生缺陷。
肥胖对女性生育力的影响也不小。肥胖可令女性患代谢综合征、乳腺癌、妇科肿瘤的风险升高，如果肥胖与内分泌紊乱有关，女性还易出现排卵障碍，本身就不容易受孕成功。
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